القسم الأول: جمع فيه المؤلف التعريفات والنظرات العامة، وعناصر الغزو بالحيل ووسائل المكر غير المباشر. واشتمل هذا القسم على أربعة عشر فصلاً.
القسم الثاني: جمع فيه المؤلف ما يتعلق بالهجوم المباشر على الإسلام عن طريق إثارة الشبهات على شرائعه وأحكامه ودفع ذلك بمنهجية علمية، واشتمل هذا القسم على سبعة فصول.
القسم الثالث: وجمع فيه نظرات عامة حول دوافع الغزو في الناس، وتلخيصاً عاماً وتوجيهاً للمسلمين.
أجنحة المكر الثلاثة وخوافيها: التبشير - الاستشراق - الاستعمار: دراسة وتحليل وتوجيه